Eustigmatophyceae es un grupo pequeño (7 géneros, aproximadamente 12 especies) de algas protistas que incluyen especies marinas, de agua dulce y de suelo.¹ Todas son unicelulares, con células cocoides y membranas celulares de polisacáridos. Presentan uno o más cloroplastos de color verde amarillo que contienen clorofila "a" y los pigmentos accesorios violaxantina y ?-caroteno. Los zoides (gametos) poseen uno o dos flagelos que surgen del ápice de la célula. Al contrario que en otros Heterokontophyta, los zoides no tienen los orgánulos fotoreceptores típicos (o estigmas); en su lugar, presentan un estigma rojo-naranja fuera del cloroplasto, situado en el extremo anterior del zoide.

En términos de ecología, los eustigmatophyceae son autótrofos fotosintéticos. La mayoría de los géneros viven en de agua dulce o en el suelo, aunque Nannochloropsis contiene especies marinas picofitoplanctónicas (2-4 ?m).